本实验室配备超净工作台、高压灭菌锅、恒温振荡培养箱、高速离心机、恒温恒湿培养箱、生化培养箱、超低温冰箱、植物光合作用测定仪、紫外分光光度计、PCR仪等仪器设备。
微生物学实验室主要承担了园艺、设施农业科学与工程等专业的《基础微生物学》、《普通遗传学》、《食用菌栽培学》、《园艺植物病理学》等课程的实验实训任务，可开展“微生物（细菌、真菌、放线菌、酵母菌、病毒等）的形态观察、鉴定”，“适宜培养基（固体、液体）配方的确定”，“植物病害的形态鉴定”、“植物病害的生物防治”等教学与科研工作。同时，为职业资格考试工作提供平台。
近几年，实验室共承担省部级科研项目8项，学生利用本实验室立项国家级大学生创新创业训练项目，利用本实验室进行创新创业活动，取得山东省大学生科技创新大赛一等奖1项、三等奖1项，山东省“互联网+”大赛铜奖1项，山东省大学生课外学术科技作品竞赛三等奖2项。
